农业氯化铵常常用于水稻的基肥和追肥，同等量的氯化铵和其他氮肥相比，效果要好很多。
氯化铵用于稻田，肥效平稳持久，流失较少。因氯化铵的铵离子易被土壤吸收，氯离子能抑制硝化细菌的活动，使硝化和反硝化的脱氮作用难于进行，可使铵离子较多地保存于稻田中。据试验，把氯化铵、硫酸铵、尿素三种化肥同时施入水田14天后，测定出土壤中的硝酸态氮各为1ppm，9ppm、14ppm，过28天后测定，硝酸态氮各为78ppm、112ppm和196ppm。说明施氯化铵比施硫酸铵、尿素的硝化作用大为减弱。
在等氮量的条件下，氯化铵肥效与尿素相当，比尿素来得快。据农技部门试验，按等量氮施用，水稻每增加一个分蘖，氯化铵只需4.6天，而尿素要6.9天。据8个试验点的水稻植株高度和有效穗统计，施用氯化铵的株高为84.1厘米，有效穗为23.38万个，而施尿素的分别只有83.3厘米和22.26万个。
氯化铵可作基肥和追肥，每亩施用量一般为10～15公斤。但应注意，不要作种肥和秧田施肥，以免影响种子发芽和造成烧苗现象；一些忌氯作物如甘蔗、烟草、马铃薯、葡萄、柑橘等不宜使用，以免降低产品的品质。
